Подскажите пожалуйста, нужно ли отцу согласие матери для въезда в ГОА с сыном.

Отменили это

Не нужно. Главное, чтобы не было запрета на выезд из страны. Если ребенок маленький и не может подтвердить кем ему приходится сопровождающий дядя, то нужно свидетельство о рождении или, в крайнем случае, чтобы ребенок был вписан в рус паспорте родителя. У меня летом проверяли именно таким образом в Шереметьево

Нет не нужно .