Подскажите, пожалуйста, белорусская master card на кубе работает?

Если банк не санкционный - должна.

По идее должна работать, проверяйте лучше в нескольких разных терминалах (может иногда не сработать по причине тех. проблем у какого-то конкретного терминала). В каком-то магазине карта пройдёт, а в другом может и не сработать.