Люди на территории США с РФ Загран паспортом и грин картой США и хотят купить через сайт билет внутренний с перелетом по США - на ЗП РФ паспорт это можно сделать?

В США паспорт нужен только для пересечения границы, то есть для международных перелетов, внутри страны вы будете показывать только гринкарту, поэтому ответ положительный

Конечно можно. Никаких проблем.