Подскажите пожалуйста, японская виза заканчивается, самолет из Японии 1:20 следующего дня. Могут ли возникнуть проблемы? Или если я попаду в зал ожидания посадки до 00:00 все будет в порядке?

она в полночь с 11 на 12, например, закончится, емнип (т.е. дата без "включительно"). но могу ошибаться

Обычно срок визы отсчитывается со следующего дня после прилёта. Наверное, главное, вовремя пройти иммиграционный контроль.