А если ехать на автобусе из куала лумпура в Сингапур, а на самолете обратно, пустят без визы по транзиту трёхдневному ?

То вас не пустят, но хоть джохор бару посмотрите

Можно только в страну, отличную от той, из которой прибыли. Если вы прибыли как угодно из Малайзии, то вы обязаны именно вылететь и именно не в Малайзию