Буду ехать с Киргизии в Казахстан с российским внутренним паспортом, пройду ли границу? кто-нибудь сталкивался? скажите пожалуйста

Никаких проблем.

Спокойно едьте.

Эти границы можно проходить как по внутреннему паспорту РФ, так и по загранпаспорту. Как вам удобно.