Нахожусь сейчас во Франции по визе С и уже есть виза D во втором паспорте ( VLST на год).

Штамп нужен в паспорт с визой д- это же доказательство вашего въезда. При валидации указывается дата въезда. Говорят, что при продлении могут и паспорт со штампом посмотреть. Я пока не продлевался- не знаю.

Я правильно поняла, что у вас временная виза D vlst?

Вы можете ее использовать в течение срока действия как пожелаете, она никак не связана с внж, она не подлежит валидации, у вас не будет необходимости её предъявлять для подтверждения въезда.

Главное, что въехали вы легально, находиться во Франции будете легально, и покинете Францию в срок.

В визовом кодексе не идёт речь об "открытии- закрытии" визы, это документ, который разрешает въезд и пребывание в стране согласно условиям.

Была бы у вас vls-ts, то немного другая ситуация, хотя тоже некритично, а с vlst вообще не усложняйте себе жизнь.