Сколько оставить в запасе времени для пересадки в Стамбуле из Москвы в Германию. Полетим аэрофлотом и туркишами. Есть ли разница с багажом или без с транзитом.

2-3?

туркиши это получается новый стамбул? я бы минимум пару часов закладывал если вы налегке, но если у вас багаж, который забрать и заново оформить, то еще больше - 3-4 часа минимум. Лучше пару лишних часов посидеть в аэропорту, чем потом вообще не улететь из за опоздания или очереди на паспортном.