Такой вопрос, если я гражданин России и прописка годовая в Азербайджане заканчивается, как быть надо пересечь границу или как?

Нужно было за 30 дней до конца подавать на новую

после прибытия в Азербайджан в течение 14 дней оформляете временную регистрацию (на 90 дней). Затем оформляете разрешение на временное проживание сроком на 1 год (госпошлина 120 манат, рассмотрение заявления занимает до 30 дней, учитывайте этот факт и советую подавать доки сразу после оформления временной регистрации, чтобы до истечения 90 дней получить удостоверение на 1 год).

Через 11 месяцев (за 1 месяц, а лучше за полтора до окончания годового разрешения на проживание) повторяете процедуру - подаете документы на продление разрешения на временное проживание (уже можно указать срок продления на 1 или 2 года, заплатив соответственно 120 или 240 манат). И до истечения срока первого разрешения в 30-и дневный срок получаете новое разрешение, не покидая страну. Сам через это прошел.