Подскажите, в транзитной зоне аэропорта Баку можно ли расплатиться долларами?

Можно

Можно. В магазинах duty-free цены указаны в евро, а в долларах с вас возьмут примерно 1,1 доллара за 1 евро. А в кафе, где цены указаны в манатах, с вас возьмут 1 доллар за каждые 1,69 маната с небольшим округлением.