У меня есть неоткрытый греческий шенген, сроком до 10 сентября. В Грецию я не собираюсь, а вместо нее хочу на 5 дней съездить в Германию.

Лучше влетайте в Грецию, а оттуда в Германию

Если не хотите аннулирования визы немецкими и любыми другими таможенниками стран ЕС , а также возможность почти что навсегда забыть про греческий шенген (греки вам не простят обман - вы просили греческую визу для въезда и проживания в Греции, а не в Германии) - то поступайте по правилам. Въезжайте по воздуху в Грецию, а оттуда по земле в Германию.