Если на туркишах через Стамбул лететь с выходом в город, потом в аэропорту только вещевой контроль?

В смысле только вещевой? Заново все проходить.

И паспортный тоже

На входе в аэропорт проверяют( если будете выходить и если много рейсов, может быть небольшая очередь), потом на регистрацию, паспортный, досмотр.