Скажите пожалуйста , если автобус компании Метро , отходит от Бургаса в 21.30, успеем ли мы пересечь границу Болгарии до 12.00?

не факт

Если автобус отправится вовремя, и вы быстро пройдете границу, то возможно. Быстро - это минут за 40. В высокий сезон это маловероятно, так что рискуете.

От Бургаса до границы 1.5 часа едет автобус

Нет. До границы около 3, 3,5 часов. Пересечение границы тоже займёт время.