Подскажите кто знает, если лететь компанией индиго из Абу Даби в Пхукет через Мумбаи, нужна ли виза Индии? и такой же вопрос если через Дели другой компанией?

Если компании разные - виза точно нужна. Если одна компания - необходимо уточнить именно у нее по вашему личному кейсу.

Зайдите в Тиматик на сайте KLM или IATA, проверьте у них

Вы можете пойти в офис индиго, если есть в вашем городе.

Обычно, если вы летите в другую страну и тем более без багажа, то вы не будете проходить миграцию в Мумбае, а пойдете в транзитную зону, где визу не спрашивают.