Первый раз едем в Калининград. Подскажите, если галочку в приложении не поставили, но отдельно запросили упд жд на сайте литовском и заполнили анкету так пропустят?

Упд жд оформляется при покупке билета, иным способом вы его не запросите. На сайте только анкета. Вам нужно сдавать билет и выкупать его снова.

Если вам Литва пришлёт визу, то наверное да, лучше это уточнить в посольстве и в ржд Я вот не уверена можно ли её запросить отдельно от покупки билета. Заполнение анкеты не является запросом.

У меня такая же проблема, не поставила галочку, пошла узнавать на вокзал в кассу там сказали сдавать билет и заново выкупать. Два часа нервов и переживаний, но получилось выкупить этот же билет снова, надеюсь и у вас получится.