Подскажите пожалуйста кто знает, как лучше проехать из Атырау в Алматы,где хорошие дороги и т.д. Машина новая не охота попасть по кочкам

Советую выехать в Россию на ближайшем погранпереходе, доехать до Кургана, и затем через Боровое приехать в Астану.

через КЗ по сути всего одна дорога и треть ее будет в очень так себе состоянии. Как вариант поставить на ЖД или автовоз. Либо на худшую часть дороги (до Актобе-Иргиза), либо полностью заказать доставку. Будет быстрей и дешевле, чем пытаться объехать КЗ. Но возят обычно новые авто. В вашем случае ехал бы на машине не спеша, аккуратно. Даже заложив лишние сутки ( с десятикратным запасом) - вариант будет простым, не дорогим, относительно быстрым