Подскажите, пожалуйста, как проходит оплата поездки в Яндекс такси в Киргизии через российские карты? Спишутся деньги с привязанной российской карты?

К сожалению, нет. Нам пришлось подвязывать карту Казахстана

Карту надо отвязать и платить наличными.

Российской картой можно оплатить поездку в Казахстане. В Кыргызстане российская карта не сработает. Также можете указать наличные, а оплатить переводом водителю со Сбер или Тиньков на МБанк. Курс плохой будет 0,9.