Подскажите пожалуйста,я правильно понимаю,что с Д визой в Венгрию можно влететь через Германию, например, а не Венгрию?

Можно, но вопросы неизбежны

можно - но могут быть вопросы (это как с первым вьездом по мультику - вас никто не ограничивает в стране вьезда, но спросить или решить что вы нецелевым образом использовали визу - тоже могут)

Приветствую ! Был опыт, на часа полтора был задержан

В следующий раз сказали , что полечу обратно

Можно. Я вьезжал через Литву, литовцы просили показать маршрутный лист до Будапешта. Больше вопросов не было.