Возможно ли заехать в Чехию по немецкой визе Д ? Знаю что погранконтроля нет, но при заселении в хостел могут ли возникнуть проблемы ?

Откуда заехать? Раз нет контроля, то видимо из страны шенгена? Вы имеете право находиться как турист до 3х мес в полгода в стране шенгена по визе Д (кроме соответственно страны визы).

Думаю, в хостеле точно всем всё равно. Правда, в Чехии в отеле только раз отдыхали. Им там вообще без разницы было.