Подскажите, могу я выехать из РФ по внутреннему паспорту а заехать в Казахстан по загранпаспорту? То есть на российском паспортном контроле показать внутренний, а уже на казахстанской стороне показать загран?

Нет, так нельзя, на обоих граница должен быть один документ

По опыту. Заехали знакомые в РК по паспорту РФ, а надо было по заграну. Дело было в Алматы. Выехали по РФ из Казахстана, заехали в Кыргызстан по заграну и после уже обратный путь в Казахстан.

Пройдет ли такой номер на границе РФ - РК, не знаю. Но там на границе не было вопросов - с чем заехал, с тем выехал.

Можете. Я так делал. Видимо, комментаторы выше не поняли суть вопроса. Пограничникам казахстанским нет дела, есть ли у вас печать на выезд из РФ. В некоторых случаях её не ставят вообще, даже если по заграну выезжаешь