Думаю какие брать билеты Москва-Манила-Москва или Москва-Себу-Москва. Подскажите пожалуйста есть ли смысл вообще посещать Манилу?

посмотрите по ценам посчитайте

если не хотите по Лусон ездить (рисовые поля, вулкан), а только острова хотите или серфинг то имеет смысл до Себу

Тоже думала между Манилой и Себу , но смотря куда вы дальше хотите, если на Бохол- то в Себу