Скажите пожалуйста, это нормально и ничего страшного, если я выеду ровно на 90-ый день безвизового пребывания в Казахстане?

По идее нормально. Но может зависеть от капризов конкретного пограничника, как он посчитает ваши дни и насколько у него всё "сойдётся"

Я знаю примеры, когда просрочили РВП на пару часов (!), в аэропорту дотошный пограничник не допустил на рейс, человека вернули со всей процедурой нарушения - суд, штраф и т.д. Там даже судья, назначая штраф, поворчал, что с таким "нарушением" можно было бы и пропустить на месте

Может быть лучше не рисковать и выезжать на 87-89 день