Подскажите есть ли возможность купить автомобиль в эстонии и оставить его на эстонском учете?, гражданство РФ и Израиль.

Если есть человек, резидент Эстонии, которого можно вписать ответственным пользователем, то без проблем. Я с этим же кейсом езжу на эстонских машинах уже 10 лет. У меня сестра живёт в Эстонии.

На учет в Эстонии чтоб поставить, нужно или доверенное лицо в Эстонии или ВНЖ Эстонии

Вы сами не сможете посиааить на учёт.

Купить сможете

Купить можете. На эстонский учет поставить - только на резидента ЭР ( а себя пользователем записать)