Кто подскажет, не могу найти информацию, если дети вписаны в паспорт РФ, там же стоит миграционная печать, нужно ли дополнительно ставить штамп о гражданстве в свидетельстве о рождении для пересечения границы Абхазии?

Достаточно того, что на записи о детях в паспорте есть штам об их гражданстве. Выехать за границу вы сможете. Но штамп о гражданстве в свид-ве о рождении может понадобиться в других случаях. Например, если вы с детьми не едете.