Подскажите, насколько имеет смысл рассматривать вариант подачи на D2 визу внутри Португалии?(Статья 89.2)

Это разное - виза Д2 лучше, так как вы не ждете 2х лет до получения карточки, а получаете ее в 4-5 месячный срок, в отличии от статьи 89.2 - где потребуется ждать приглашения около 16-18 месяцев.