Подскажите, пожалуйста, сейчас проживаю в Германии, но являюсь гражданкой Литвы. Заключила контракт по работе ( онлайн)

По идее, если вы устроены в штат компании, то надо будет зарегистрироваться как “работник, работающий в найме на не немецкую компанию) ”. Если я правильно понимаю, для этого надо получить Betriebsnummer для вашей литовской компании. Это нужно для того, чтобы оплачивать социальные взносы. Но может быть, так как вы гражданка страны ЕС, есть какие-то нюансы. Я бы проконсультировалась с каким-то юристом по налогам, чтобы он вам чётко рассказал куда идти и что делать шаг за шагом.