Гражданин Азербайджана получил разрешение на трудовую деятельность на три месяца в Казахстане, а РВП ему Миграционка сделала на 2 месяца.

Во-первых, выяснить, почему миграционка выдала разрешение на два месяца вместо трёх. Как этого никто не заметил? Сам РВП был же выдан (документ с QR кодом). Скорее всего, либо ошибся тот, кто подавал документы на РВП (указал не те даты в ходатайстве), либо миграционка (неправильно считала даты из ходатайства). В любом случае, это надо выяснять в той миграционке, которая выдавала РВП.