Планируем вылетать с Пхукета в Москву. Но билеты на авиасейлс кусаются прямые. Нашла более выгодный вариант.

Можно, если у вас билет в одну сторону, с туда-обратно лучше так не рисковать, либо подробно изучать правила авиакомпании на случай неявки на первый сегмент.

Так - можно. Если у вас один перелёт . Ни в какой список вы не попадёте , ничего не будет. А вот если , к примеру вы брали бы билеты екб-мск-пхукет и попытались бы сесть в мск , они бы были анулированными.