Подскажите пожалуйста - если стартовать из Вильнюса утром и ехать через всю Литву в Чернышевское за янтарем, когда примерно выдвигаться, с учетом, что путь неопробованный ни разу(?

Ехали один раз, но все комфортно. Электричка на 10 Вильнюс-Каунас-Кибартай вполне.

Там все просто, понятно и близко, но вокруг границы идти пешком.

Я уже ответила на Ваш вопрос раньше, подробно. Выехала из Вильнюса на электричке в 10,10, успела, почти не ждала "Янтарь" в Чернышевском.