Кто может подсказать - прилетели в Ванкувер, как-то пропустили момент с тем, что в аэропорту надо сразу ворк пермит оформлять, офицер ничего не сказал.

Попробуйте поехать в аэропорт, пойти в immigration. люди так ездили на следующие дни, исправляли ошибки в воркпермитах, их пускали. это самый эфффективный путь. именно про Ванкувер речь.