А можно ли при предъявлении справки об остатке на счете (российском) предоставить выписку по кредитной карте для подачи на визу Японии?

Если в выписке не указано, что карта кредитная - то можно, некоторые банки в выписке указывают тип счета, а некоторые - нет. Посмотрите в приложении какая выписка у вашего банка.