Имеется план сделать второй загранник ( нахожусь за рубежом) и послать его почтой в Россию для оформления японской визы.

Если вы находитесь за рубежом по длительной учебной , рабочей ( например) визе или у вас есть внж, то подаете у себя там. Если нет, подать здесь , конечно, можно. Проверить могут, например, позвонить по вашему номеру в анкете. Узнать на работе, если на удаленке. Насколько строго проверяют не знаю, но вопросы , особенно если москвич или из спб ( сами могли прийти) возникнут точно.

люди получили отказ, если их не было на территории РФ. Но есть и успешные истории. То есть, если и проверяют, то видимо не всех, как повезёт. Но точно будет отказ, если они это обнаружат