Подскажите, если есть два ИП в Грузии, и один другому хочет заплатить по инвойсу - обязаны ли они указывать сумму в инвойсе и переводить деньги в лари, а не USD?

Расчет в Грузии по бизнесу по закону - только в лари.НДС возникает, если сумма услуг, местом оказания которых для целей НДС является Грузия, превысит 100 к лари/12 мес. Услуги, оказываемые грузинскому бизнесу, естественно, относятся к таким услугам. В нем есть ответы и на первый Ваш вопрос, и на второй.