Подскажите если гражданину рф сделать в Кыргызстане у местного нотариуса доверенность на продажу недвижимости в рф на родственника- гражданина рф, эта доверенность будет действенна в России, не будет проблем?

Не будет проблем, если сформулировать всё верно, доверенности признаются.

Обратите внимание на один момент: если на печати нотариуса будет хоть слово по-кыргызски, в РФ могут потребовать перевод печати. Поэтому лучше его сделать сразу в КР.