При посадке на автобус(кто ездил, объяснит пожалуйста) Вильнюс-Минск где проходит паспортный и таможенный контроль?

На границах, очевидно.

Паспорт и основание для посадки в автобус смотрит водитель автобуса. Остальной контроль на границе.

Контроль на границе ножками выходите по очереди в окошко документы . Вещи ( у беларусов) на ленту досмотр в помещении ( может и не быть).Водитель автобуса сажает вас по билету и всем проездным документам .