Помогите советом, пожалуйста. Являюсь гражданкой России и Израиля.

Вы же не лишились гражданства Израиля. И влетать в страну нужно по паспорту Израиля. В любом случае потребуются объяснения в Вашем случае.

По биометрии в паспорте распознают. Израильское гражданство скрывать не надо. Многие девушки выходят замуж и после этого не служат, ваш случай не уникальный. Загранпаспорт Израиля (теудат Маавар) нужно получить на новую фамилию (старую тоже в нем напишут, в скобках).

Будите распознаны , может быть к вам останутся вопросы но в армию вас уже не возьмут)