Подскажите, по опыту, в каком городе в мвд меньшая очередь на подачу документов/получение готовых для новых репатриантов? и можно ли жить в одном городе, а подаваться в другом?

Сроки получения от города не зависят. Можно подаваться в любом городе, где есть слоты. А слоты - это вопрос удачи, их надо ловить.

Можно подаваться в любом. Очереди везде примерно одинаковые. Где поймаете очередь - там и подавайтесь, в среднем день-два если вам надо в ближайшем городе найти очередь.