Подскажите пожалуйста, если кто-то недавно влетал в Германию из Стамбула, спокойно ли пускают по шенгену?(Стоит французский шенген, влететь надо в Мюнхен)

Да вроде нет никаких проблем. Имейте при себе бронь отеля (не на русском!), обратный билет, действующую в ЕС страховку, подтверждение средств к существованию из расчета примерно 100 евро на человека в день (помимо отеля), и внятное описание целей визита и маршрута Но могут и ничего не спросить вообще.

Если виза уже открыта, то норм, а если- нет, то на мой взгляд лучше подобрать аэропорт французский.