Может подскажите, как лучше сделать: Недавно репатриировались в Израиль, есть на руках наличка в евро и долларах, как лучше сделать?

В банку, лучше в железную... можете пользоваться и не платить комиссию.

Если даже положите в валюте, снять будет возможность только в шекелях по курсу. Проценты банки берут по всем, практически, операциям по карте. Положить деньги можно на малый срок (даже неделя) под %, т. о. если будете снимать не потеряете много от процентов. И в банке можно поторговаться, относительно размера процентов.