Подскажите пожалуйста кто знает, можно ли летать на самолете в пределах Турции, если закончилось время пребывания в стране?

Технически можно.

Можно, они сверяют только фамилию, никто на даты не смотрит. Более того, лучше самолетом, потому что автобусы иногда более подробно проверяют.