Подскажите, если есть уже счёт физлица в BoG то есть вариант как-то проще открыть бизнесс-счёт, или нужно опять пошлину платить и KYC заполнять?

Нет. наличие физ счета не является каким либо приимуществом для открытие ип счета) опять платить и заполнять и ждать)

Меня в отделении отправляли ещё раз платить и заполнять форму на ie. bog. ge.

Бумажный вариант в прям в отделении не спрашивали? Там на 4х или 5ти листах выдают.