Подскажите, кто знает, пожалуйста. Человек с визой сопровождающего по Д7 может пойти в SEF на подачу документов без основного заявителя? На ВНЖ уже в Португалии имею в виду.

У него если есть запись своя, то по идее да.

Лучше подстраховаться и приходить на подачу вместе с основным заявителем. Это достаточно стандартная ситуация, когда у сопровождающего без основного заявителя могут не принять документы.