Можно ли не распечатывать ваучер отеля для перелета на Мальдивы? А иметь его в телефоне в электронном виде? .

Можно.

На мой взгляд серьезно никак не скажется. Наш опыт - в Аэрпорту встретили и дали ваучер, по прилету в отель сразу встретили с музыкой, напитками, холодным полотенцем, дали распечатку для подписи по поводу отсутвий алерргиии и предпочтений по еде; вручили ключи от номера.