Подскажите, можно ли получить туристическую визу на 90 дней непрерывного пребывания в Японии? Просто где то пишут что только 15 дней можно, где то пишут что можно и три месяца беспрерывно.

По правилам можно, главное чтобы деньги были на такой долгий период, ну и жилье билеты оплачены.

Если покажите им программу и оплату отелей на 31+ дней - дадут на 90 дней.

Можно. На 15/30/90 дней. Прикладывайте план на всё время поездки и финансы.