Подскажите посольство Японии выдало визу не на ту дату которая указана в авиабилете, поменяют ли они на нужную дату?

Та же 3 месячный коридор въезда, конкретные даты - это начало и окончание коридора.

Если это их техническая ошибка, то конечно. Был опыт переклейки шенгенской визы за 15 минут (похожая история)