Купила билет на Ласточку поезд, там онлайн оплатить багаж отсутствует опция. Какие там ограничения в плане багажа?

Никогда проблем не было, максимум предложат оплатить на месте.

Чемодан S размера спокойно помещается на полку для багажа сверху. Туда же можно положить любую ручную кладь. А для чемоданов М, L и ХL предназначен отсек для крупного багажа в каждом вагоне. Если, к примеру, по маршруту посадка и высадка производится только из 1-го, 3-го и 5-го вагонов, а остальные двери при этом блокируются и не открываются, то к этим дверям обычно тоже можно спокойно поставить вещи. Видели бы Вы Ласточку СПб-Псков весной! Там люди везут столько тележек с ящиками рассады! И чемоданы, и рюкзаки. Не думаю, что на это все оформляется багажный билет. Но на всякий случай можно уточнить по телефону единой справочной РЖД 8-800-775-00-00.