Из Загреба в Лейпциг бывают прямые рейсы на самолет?

Нет, только с пересадкой. На сайте аэропорта Загреб есть раздел red letenja, Лейпцига нет в списке. Можно так проверять. А можно в поисковиках билетов задать направление и смотреть по датам и убедиться, что нет прямых рейсов. Из Загреба в Германию летает Croatia Airlines, Lufthansa, Eurowings. Был Франкфурт, Дюссель, Штутгарт, Мюнхен, проверяйте!