У кого есть ИП в Грузии, скажите, пожалуйста, если у меня два счета, ИП и физический, с какого нужно оплачивать налог? Или это неважно?

Лучше с бизнес, в счёте указан ваш ИНН и деньги точно дойдут до вашего ИП в налоговой.

Если так открывать счета то налоги платить именно с со счета ип.