Я правильно понимаю, что минимальный доход не увеличивается сверх €3040, если есть жена. Только на счету денег больше должно быть для Португалии?

Нет, нужно просто развестись))))

По делу - да, жена и дети отдельно сверху считать надо, но вроде не по 3040, а по количеству денег на счете. То есть 3040 - это в семье доход, а вот на счете денег - там надо прибавлять и детей и жену как отдельных сверху.