Скажите, а booking com будет работать с моим российским аккаунтом, если я территориально буду находиться в Индии?

Будет.

Букинг будет с вашим аккаунтом работать в любой стране. Просто через него именно на территории России забронировать ничего нельзя. То есть они санкции на российские отели наложили, а не на российских путешественников.